מפקדת הזרוע לבניין הכוח ביבשה (מז"י) הוקמה ב-1999 על בסיס מפקדת חילות השדה (מפח"ש). לצורך מימוש אחריותה, העבירו למז"י גורמים שונים מהמטה הכללי סמכויות ומשאבים, וביניהם - מסגרות תקציב נוספות על אלו שהיו למפח"ש.
מז"י פועלת על פי תכניות עבודה רב-שנתיות ושנתיות, שמאשר לה המטכ"ל. אחד המשאבים העיקריים העומדים לרשותה לשם השגת יעדיה הוא מסגרת תקציב רב-שנתי לביצוע התקשרויות, והיא נושאת באחריות לאופן מימושה בתחומי התכנון, הביצוע והבקרה.
בביקורת עלה, כי אין במז"י מתודולוגיה מגובשת לתכנון תכניות עבודתה, הכוללת אמות מידה ומדדים להתוויית עבודת התכנון. ממילא, הליך התכנון אינו מעוגן ומפורט דיו בהוראות הזרוע.
מז"י מבצעת תכניותיה תחת מסגרת תקציבית הנתונה לשינויים. בנוסף לאי-הוודאות התקציבית היא פועלת בסביבה דינמית, המחייבת אותה לספק מענה לאיומים משתנים. בביקורת עלה, כי חרף אי-הוודאות בסביבת העבודה, שיטת התכנון שקיימה מז"י בשנים 1999-2001 לא ענתה על הצורך להגיב לשינויים בנסיבות, תוך כדי שמירה על יציבות תכניות העבודה. בנסיבות אלו, נאלצה מז"י להפסיק, לפרוס מחדש, או לדחות פעילויות שהוחל בביצוען, במטרה להתכנס למסגרות התקציב שקוצצו, ולפנות תקציבים עבור צרכים חדשים, בלתי צפויים. לדפוס פעולה זה היה מחיר כלכלי, שנבע מהעלויות שירדו לטמיון בפעילויות שהופסקו, ומעלויות הכרוכות בפריסת פעילויות פיתוח והצטיידות על ציר הזמן - מחיר שהזרוע לא בחנה.
עוד עלה בביקורת, כי אין בזרוע אמות מידה מוגדרות, שלפיהן ייבחנו ויאושרו פעילויות, שאינן כלולות בתכנית העבודה או החורגות ממנה. מז"י אף אינה מסתייעת דיה בתקציב ובתהליך מימושו למעקב אחר ביצוע משימותיה, ובכלל, אין במז"י גורם בקרה, העוקב אחר סטיות מתכנית העבודה ואחר ביצוע שינויים במהלך השנה, בניתוח הסיבות לשינויים ובהערכת עלותם.
מז"י נושאת, בין היתר, באחריות לפיתוח, להצטיידות ולקליטת אמצעי לחימה, כמענה לצרכים בתחום הביטחון השוטף. נמצא, שהקצאת מקורות התקציב של הזרוע לתחום זה הייתה חסרה באופן קבוע, לאורך שנים, והמקורות שנדרשו בפועל היו גבוהים בהרבה מאלה שהוקצו. עוד נמצא, שבבואה לתכנן מקורות תקציב לתחום זה, מז"י נסמכת על הבנה עם המטה הכללי, ולפיה הוא יתגבר את תקציבה בהתאם לאירועים המתפתחים בתחום הביטחון השוטף. הבנה זו אינה מעוגנת בהחלטה כלשהי, ובפועל, תוספות ייעודיות שקיבלה הזרוע לתחום הביטחון השוטף לא כיסו את הפער שבין הצרכים לבין תכנון המקורות, ומז"י נאלצה להשלימו מתקציבי ההתעצמות שלה, מבלי שנערכה לכך.