קופת חולים כללית- התארגנותה המשפטית כאגודה וכחברה - קופת חולים כללית מאורגנת בשתי מסגרות משפטיות שונות- אגודה וחברה. האגודה היא זו הנותנת את השירותים לציבור. החברה עמדה לבוא במקום האגודה ולקבל עליה את ניהול ענייניה ופעולותיה של האגודה וכן את הבעלות והחזקה על כל נכסיה. אולם תהליך זה נפסק בשל קשיים בביצועו, וכל מה שיושם הוא רישום רבים מנכסי האגודה על שם החברה. לחברת העובדים ולהסתדרות הכללית זכויות מיוחדות המקנות להן שליטה בענייני החברה. התארגנות זו גורמת סרבול בענייני הקופה ובמיוחד בניהול נכסיה.
קופת חולים כללית- זמינות שירותי הרפואה המקצועית במרפאות - בבדיקה שעשה משרד מבקר המדינה, ביוני 1993, בנושא זמינות שירותי הרפואה המקצועית במרפאות של קופת חולים כללית נמצא, שבמקומות רבים חל שיפור ניכר ברבים מהשירותים המקצועיים, שבהשוואה לבדיקות קודמות, אולם עדיין היו מקרים רבים שזמן ההמתנה לרופאים מקצועיים, לייעוץ ולבדיקות היה ממושך מאוד.
ברוב המקומות שנבדקו לא היה בידי ההנהלות מידע מלא ומעודכן בדבר משך התורים לשירותים המקצועיים השונים.
במקומות אחדים דרכי קביעת התור לא היו יעילות.
היו מקרים, שחולים המתינו במרפאות זמן רב (שעה ויותר), אף שנקבע להם תור לשעה מסוימת.
בבדיקה שנערכה בפבואר 1993 בבתי המרקחת של הקופה הועלה, שהיא מחסור בתרופות, ושההסדרים להשגת התרופות החסרות לא היו מספקים. בבדיקה ביוני הועלה שהיה שיפור בתחום זה.
המכשור בכמה מרפאות לא היה תקין.
בכמה מקומות היו תנאים פיסיים לקויים.