במחלקת הכספים של משרד הבריאות, בקופות החולים (קופת החולים של ההסתדרות הכללית, קופת החולים לעובדים לאומיים,קופת חולים מכבי וקופת החולים המאוחדת), ובבתי החולים הממשלתיים הכללים תל השומר, רמב"ם ואיכילוב נערכה ביקורת על דרכי ההתחשבנות בגין דמי אשפוז. במחלקת הכספים של המשרד נבדקו גם דרכי התיקצוב של התמיכות בבתי החולים הציבוריים. במשרד הבריאות ובקופת החולים של הסתרות הכללית נבדק נושא הקטנת כוח האדם במערכת הבריאות.