מע"צ היא היחידה ההנדסית למתן שירותי בנייה למגזר הממשלתי. ממצאי הביקורת, שהועלו בבדיקת שתי עבודות, אותן ביצעה מע"צ בעבור שירות בתי הסוהר, יש בהם כדי להצביע על כך, שלא עלה בידה להבטיח, שהעבודות יבוצעו ביעילות ובחסכון כראוי לגוף ממשלתי, הנדרש להקפיד על ניצול חסכוני של תקציב המדינה. אדרבה, אף כשלוקחים בחשבון את השפעת השינויים, שדרש שירות בתי הסוהר כמזמין, עדיין נותרו חריגות בלתי מוסברות - בסכומים נכבדים מאוד - מעבר למגיע על פי תעריפי מע"צ וההסכמים שחתמה.
על משרד הבינוי והשיכון ומע"צ, בתיאום עם משרד האוצר, כאחראי על מימון הבנייה הממשלתית ועל סדרי מסירת עבודות, להנהיג הסדרים, שיגבירו את אחריותה של מע"צ ואת מחויבותה לשמור על המסגרת התקציבית ולוח הזמנים בעבודות שבטיפולה. יש מקום לבדיקה יסודית לגבי אופן טיפולה של מע"צ בשני הפרוייקטים, אליהם התייחסה הביקורת, כדי לעמוד על אחריותה להוצאות המיותרות ולעיכובים בביצוע, כדי להפיק את הלקחים המתאימים לגבי העתיד.